Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms