Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGAEP38570 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGAEP38570 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms