Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHI3L1P36222 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms