Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT2P35908 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT2P35908 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT2P35908 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT2P35908 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT2P35908 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms