Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB2P35606 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB2P35606 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms