Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms