Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG3P32926 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG3P32926 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG3P32926 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms