Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms