Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms