Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLD1P28340 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLD1P28340 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLD1P28340 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLD1P28340 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLD1P28340 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLD1P28340 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLD1P28340 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLD1P28340 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLD1P28340 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLD1P28340 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms