Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4AP27815 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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