Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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