Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HRCP23327 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HRCP23327 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HRCP23327 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HRCP23327 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HRCP23327 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HRCP23327 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HRCP23327 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HRCP23327 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HRCP23327 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HRCP23327 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HRCP23327 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HRCP23327 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms