Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
S100A1P23297 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
S100A1P23297 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
S100A1P23297 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
S100A1P23297 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
S100A1P23297 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
S100A1P23297 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
S100A1P23297 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
S100A1P23297 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
S100A1P23297 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
S100A1P23297 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
S100A1P23297 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms