Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms