Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI1P19237 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI1P19237 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms