Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAP43P17677 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAP43P17677 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAP43P17677 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms