Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM27P14373 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM27P14373 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms