Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms