Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF35P13682 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF35P13682 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms