Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms