Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms