Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP3P08254 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP3P08254 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms