Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms