Protein–RNA interactions for Protein: P02760

AMBP, Protein AMBP, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBPP02760 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBPP02760 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBPP02760 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBPP02760 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBPP02760 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms