Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYF2O95926 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYF2O95926 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYF2O95926 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYF2O95926 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms