Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT3O95395 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT3O95395 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms