Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBNO60934 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBNO60934 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBNO60934 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBNO60934 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBNO60934 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms