Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREHO43280 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREHO43280 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREHO43280 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREHO43280 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREHO43280 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREHO43280 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREHO43280 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms