Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms