Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms