Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CUX2O14529 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CUX2O14529 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CUX2O14529 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CUX2O14529 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CUX2O14529 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUX2O14529 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUX2O14529 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUX2O14529 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUX2O14529 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUX2O14529 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CUX2O14529 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CUX2O14529 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CUX2O14529 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CUX2O14529 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CUX2O14529 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CUX2O14529 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CUX2O14529 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CUX2O14529 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CUX2O14529 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUX2O14529 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUX2O14529 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUX2O14529 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUX2O14529 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUX2O14529 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUX2O14529 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUX2O14529 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CUX2O14529 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms