Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX7O00628 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX7O00628 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX7O00628 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX7O00628 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX7O00628 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms