Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3QRK9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QRK9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QRK9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QRK9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QRK9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms