Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHLA1C9JL84 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms