Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DEV8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
B4DEV8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
B4DEV8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
B4DEV8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
B4DEV8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DEV8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DEV8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DEV8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms