Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEURL1BA8MQ27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms