Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8AA7E2F4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8AA7E2F4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8AA7E2F4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8AA7E2F4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8AA7E2F4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8AA7E2F4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms