Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms