Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF804BA4D1E1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF804BA4D1E1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms