Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms