Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms