Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms