Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0D9SFI3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms