Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 HIGD1B-201ENST00000253410 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OR14K1-201ENST00000283225 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CCDC58-201ENST00000291458 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MMP26-201ENST00000300762 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PMS2P6-201ENST00000333674 710 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC106795.2-203ENST00000366189 511 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SPACA5-202ENST00000376940 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC211476.3-201ENST00000380410 715 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SNRPCP19-201ENST00000420809 460 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC104794.1-201ENST00000425235 312 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC092634.3-201ENST00000450544 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC004947.1-202ENST00000457000 576 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL735P-201ENST00000471015 292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL400P-201ENST00000473634 296 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL748P-201ENST00000483066 311 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL584P-201ENST00000492309 297 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC073111.1-201ENST00000497366 420 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CCDC58-206ENST00000497726 438 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC233724.4-201ENST00000511894 267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC010768.3-201ENST00000525465 792 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC020611.1-201ENST00000537101 254 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL929601.1-202ENST00000551067 418 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OTX2-206ENST00000555006 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CSH1-206ENST00000610991 580 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CENPP-204ENST00000618653 570 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 WT1-AS_1.1-201ENST00000619639 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP003500.1-201ENST00000626400 527 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL078645.2-201ENST00000245811 1325 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NPIPA7-202ENST00000530217 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MYOM2-212ENST00000523438 3328 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP005264.8-201ENST00000623093 3313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RSL24D1-201ENST00000260443 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ACSBG2-206ENST00000588485 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CERS3-201ENST00000284382 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 C9orf153-201ENST00000339137 1845 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TMPRSS4-218ENST00000534111 5550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ADGRG5-201ENST00000340339 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ENTPD1-203ENST00000371207 1903 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 COL12A1-203ENST00000416123 8964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MROH5-201ENST00000430863 4164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MMP1-201ENST00000315274 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GBP2-201ENST00000370466 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RUNX1T1-215ENST00000518844 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 INTS3-201ENST00000318967 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DSG1-201ENST00000257192 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC093426.1-201ENST00000561926 3011 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NTRK3-207ENST00000542733 2287 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CACNB4-231ENST00000636721 1542 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF662-204ENST00000440367 4099 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TEX35-201ENST00000319416 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HSD17B3-202ENST00000375263 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IGLV8-61-201ENST00000390283 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MCF2L-206ENST00000397021 576 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FAM96AP2-201ENST00000414727 477 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GZMB-204ENST00000415355 923 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPL17P10-201ENST00000416091 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC01715-202ENST00000427804 688 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL390786.1-201ENST00000432108 309 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OR13C6P-201ENST00000433495 950 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PSMD10P1-201ENST00000436861 681 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC00333-201ENST00000446314 613 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CTSLP4-201ENST00000454614 1002 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC096659.1-201ENST00000456728 549 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL141P-201ENST00000484215 266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPL7AP11-201ENST00000486538 799 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPL12P6-201ENST00000495231 498 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPPH1-3P-201ENST00000516541 322 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC018620.1-201ENST00000523233 379 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IL18-202ENST00000524595 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP003031.1-201ENST00000534354 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PRSS2-201ENST00000539842 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC005476.2-202ENST00000554634 464 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC018563.1-201ENST00000558089 566 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC004706.1-201ENST00000576138 879 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CDRT15P1-201ENST00000577632 564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZIM2-202ENST00000593931 483 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC010319.5-201ENST00000598950 759 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.60-201ENST00000616888 305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC005703.5-201ENST00000623654 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL590644.1-202ENST00000634972 590 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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