Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms