Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF6Q9Y4K3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms