Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF330Q9Y3S2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF330Q9Y3S2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms