Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2J1Q9Y385 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms