Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms